Depuis 2016, la fusion des régions Bourgogne et Franche-Comté est effective, région qui pour l'association des Petites Cités Comtoises de Cractère est un partenaire incontournable.
Trois choix étaient possibles : le statu quo ; créer une deuxième association pour les cités bourguignonnes ; ou élargir le territoire à la Bourgogne. C’est donc cette option qui a été choisie.
D’ores et déjà, les statuts sont modifiés pour notamment prendre acte du nouveau nom : Association des cités de caractère de Bourgogne Franche-Comté. Le terme « petites » n’y figure plus. C’est un choix de l’association afin de ne pas rebuter des communes qui considéreraient cet adjectif comme péjoratif.
Saint-Hippolyte est donc aujourd'hui officiellement une Cité de Caractère de Bourgogne - Franche-Comté.